在《虐杀原形2》那充满混乱与危机的世界里，主角詹姆斯·海勒的命运自一开始就被紧紧卷入了一场错综复杂的阴谋之中，而跟踪博士这一关键行动，成为了他揭开真相、寻找自我救赎的重要线索。
故事发生在被黑色守望严密控制的纽约市,这座曾经繁华的都市如今已沦为一片被病毒肆虐的废墟，詹姆斯·海勒，一名原本普通的士兵，在一场突如其来的灾难中失去了家人，自己也感染了神秘的病毒，他并未像其他人一样被病毒吞噬，反而获得了超乎常人的能力，这种能力既像是上天的馈赠，又像是可怕的诅咒，让他在这个混乱的世界中挣扎求生。
博士,这个在游戏剧情中至关重要却又神秘莫测的角色，成为了海勒探寻真相的关键目标，博士名为亚历山大·格林，是黑色守望的高级科学家，他长期致力于病毒研究，掌握着许多关于病毒起源、传播以及控制的核心机密，黑色守望为了实现其不可告人的目的，一直对博士的研究成果进行严格保密，而博士的一些举动似乎也暗示着他有着自己的计划，这一切都引起了海勒的怀疑。
海勒最初注意到博士,是在一次与黑色守望的激烈冲突之后，他在战斗现场发现了一些奇怪的文件碎片，上面的信息隐隐指向博士的实验室，这些碎片文件提到了博士正在进行一项名为“净化计划”的研究项目，但具体内容却语焉不详，海勒凭借着自己敏锐的直觉，意识到博士与这场席卷城市的病毒危机有着千丝万缕的联系。
海勒开始了对博士的跟踪行动,纽约市那破败不堪的街道、废弃的建筑和弥漫着诡异气息的角落，都成了他追踪的舞台，他利用自己的超能力，在城市的高楼大厦间穿梭跳跃，小心翼翼地跟随着博士的踪迹，博士出行时，身边总是围绕着一群黑色守望的精锐部队，这给海勒的跟踪带来了极大的困难。
在一次跟踪过程中,海勒发现博士前往了一个位于城市地下深处的秘密基地，这个基地戒备森严，四周布满了各种先进的防御设施和监控设备，海勒深知直接闯入的危险性，但为了获取更多关于博士的信息，他决定冒险一试，他先是利用自己的潜行能力，悄悄接近基地的外围，然后找准时机，解决了几个落单的守卫，成功潜入了基地内部。
基地内部宛如一个巨大的迷宫,各种复杂的管道和线路纵横交错，海勒在黑暗中小心翼翼地前行，躲避着巡逻的士兵，他通过监听士兵们的对话，得知博士正在基地的核心区域进行一场重要的实验，海勒加快了脚步，朝着核心区域进发。
当他终于来到核心区域时,眼前的景象让他大为震惊，巨大的玻璃容器中，存放着各种形态诡异的病毒样本，闪烁的灯光和嗡嗡作响的仪器营造出一种令人毛骨悚然的氛围，博士正站在一台巨大的控制台前，专注地操作着仪器，似乎在进行着某种关键的数据记录。
海勒躲在一旁,仔细观察着博士的一举一动，他发现博士的表情显得十分焦虑和矛盾，似乎在进行着一场艰难的抉择，就在这时，博士突然与黑色守望的高层进行了一次远程通讯，通过通讯内容，海勒得知博士的“净化计划”并非如表面上那么简单，原来，博士发现病毒已经发生了变异，现有的控制手段已经无法阻止病毒的进一步扩散，他的“净化计划”实际上是一个孤注一掷的尝试，试图通过释放一种特殊的病毒抑制剂来彻底清除城市中的病毒，但这个计划的成功率极低，而且可能会带来意想不到的后果。
黑色守望的高层对博士的计划表示强烈反对,他们担心抑制剂的释放会引发更大的混乱，影响他们对城市的控制，博士则坚持认为这是拯救城市的唯一机会，双方陷入了激烈的争吵，海勒在一旁听得心惊肉跳，他意识到这场关于病毒的争斗背后，隐藏着黑色守望的巨大阴谋。
随着跟踪的深入,海勒发现博士的行动越来越神秘，博士开始频繁地与一些身份不明的人会面，这些人似乎来自一个与黑色守望对立的组织，海勒决定暗中调查这些人的身份，他通过一系列冒险行动，成功获取了一些关于这个神秘组织的信息，原来，这个组织名为“反抗军”，他们一直在暗中抵抗黑色守望的统治，并且对博士的研究十分关注。
反抗军认为博士掌握着对抗病毒和推翻黑色守望统治的关键,他们与博士接触，希望能够说服博士与他们合作，共同对抗黑色守望，博士虽然对反抗军的理念表示认同，但他担心自己的研究成果会被滥用，因此一直犹豫不决。
海勒意识到自己陷入了一个复杂的局面,他一方面想要从博士那里获取关于病毒的真相，找到治愈自己和拯救城市的方法；他又要面对黑色守望和反抗军这两个势力的压力，在一次与博士的短暂接触中，海勒向博士表明了自己的身份和目的，博士对海勒的出现感到十分惊讶，但他也意识到海勒或许可以成为改变局势的关键因素。
博士告诉海勒,他的身体经过病毒改造后，拥有了一种特殊的适应性，这种适应性可能是解开病毒谜题的关键，海勒听后，决定与博士合作，共同对抗黑色守望和病毒危机，他们的合作并没有那么顺利，黑色守望很快察觉到了博士的异常举动，加大了对博士的监视力度。
在一次激烈的追捕行动中,博士为了摆脱黑色守望的追击，不得不向海勒求助，海勒凭借着自己强大的超能力，与黑色守望的部队展开了一场惊心动魄的战斗，他在枪林弹雨中穿梭自如，运用各种强大的技能，将敌人打得落花流水，成功帮助博士摆脱了追击。
经过这次事件,博士与海勒的合作更加紧密，他们开始一起研究病毒样本，试图找到病毒抑制剂的最佳配方，在研究过程中，海勒发现自己的超能力似乎与病毒之间存在着某种深层次的联系，通过不断地探索和实验，他们逐渐揭开了病毒的一些秘密。
原来,病毒并非是自然产生的，而是由一个神秘的组织在多年前进行的一项秘密实验中泄露出来的，这个组织一直在幕后操纵着病毒的传播和扩散，试图利用病毒来实现他们不可告人的目的，黑色守望只不过是这个组织的一枚棋子，被利用来控制局势。
随着真相的逐渐浮出水面,海勒和博士面临的危险也越来越大，黑色守望和那个神秘组织都察觉到了他们的行动，派出了大量的精锐部队对他们进行围追堵截，海勒和博士不得不一边躲避敌人的追捕，一边加快研究进度。
在一次激烈的交锋中,博士不幸被黑色守望抓住，海勒心急如焚，他决定独自闯入黑色守望的总部，营救博士，黑色守望总部戒备森严，布满了各种先进的武器和防御设施，海勒凭借着自己坚定的信念和强大的超能力，一路披荆斩棘，杀进了总部内部。
在总部的核心区域,海勒终于找到了被囚禁的博士，此时的博士已经身受重伤，但他依然坚持告诉海勒，病毒抑制剂的研究已经接近尾声，只要他们能够将抑制剂成功释放，就有可能拯救这座城市。
海勒带着博士逃离了黑色守望总部,他们来到了一个秘密的实验室，博士在生命的最后一刻，完成了病毒抑制剂的研制，海勒接过抑制剂，肩负起了拯救城市的重任。
他来到城市的中心,不顾黑色守望和神秘组织的重重阻拦，成功地释放了病毒抑制剂，随着抑制剂的扩散，城市中的病毒逐渐被抑制，人们看到了希望的曙光。
在这场惊心动魄的跟踪博士之旅中,海勒从一个普通的士兵逐渐成长为城市的英雄，他通过自己的努力和勇气，揭开了病毒背后的巨大阴谋，拯救了无数人的生命，而博士，虽然最终付出了生命的代价，但他的研究成果和坚定信念，成为了这座城市重生的希望之光，这场关于追踪博士的冒险，也成为了《虐杀原形2》中一段令人难以忘怀的传奇故事。
